foreach％dopar％+ RPostgreSQL

タスクごとに1回ではなく、ワーカーごとに1回データベース接続を作成する方が効率的です。残念ながら、mclapplyはタスクを実行する前にワーカーを初期化するメカニズムを提供しないため、doMCバックエンドを使用してこれを行うのは簡単ではありませんが、doParallelバックエンドを使用する場合は、clusterEvalQを使用してワーカーを初期化できます。コードを再構築する方法の例を次に示します。

library(doParallel)
cl <- makePSOCKcluster(detectCores())
registerDoParallel(cl)

clusterEvalQ(cl, {
  library(DBI)
  library(RPostgreSQL)
  drv <- dbDriver("PostgreSQL")
  con <- dbConnect(drv, dbname="nsdq")
  NULL
})

id.qed.foreach <- foreach(i=1588:3638, .inorder=FALSE,
                          .noexport="con",
                          .packages=c("DBI", "RPostgreSQL")) %dopar% {
  lst <- eval(expr.01)  #contains the SQL query which depends on 'i'
  qry <- dbSendQuery(con, lst)
  tmp <- fetch(qry, n=-1)
  dt <- dates.qed2[i]
  list(date=dt, idreuters=tmp$idreuters)
}

clusterEvalQ(cl, {
  dbDisconnect(con)
})

doParallelとclusterEvalQは同じクラスターオブジェクトclを使用しているため 、foreachループはデータベース接続オブジェクトconにアクセスできます タスクを実行するとき。