テーブル内の重複を削除するにはどうすればよいですか？

これにより、重複の1つが保持されます：

delete from join_table
where ctid not in (select min(ctid)
                   from join_table
                   group by id1, id2);

テーブルには、「1人の生存者を選ぶ」ために使用できる一意の識別子がありません。そこで、Postgresのctid 各行の内部一意識別子であるため、便利です。 ctidは絶対に使用しないでください。 単一のステートメント以上のもの。これは普遍的にユニークなものではありませんが、単一のステートメントの実行時間には問題ありません。

SQLFiddleの例： http://sqlfiddle.com/#!15/dabfc/1 >

すべてを取り除きたい場合 重複する行：

delete from join_table
where (id1, id2) in (select id1, id2
                     from join_table
                     group by id1, id2
                     having count(*) > 1);

どちらのソリューションも、大きなテーブルでは高速ではありません。大きなテーブルからかなりの数の行が必要な場合は、jjanesが示しているように、重複のない新しいテーブルを作成する方がはるかに高速です。