MongoDBフィルターオブジェクトは、オブジェクトメンバーに基づいてコンテンツを配列します

qTyInを比較できます undefinedを使用 $filter 内 ：

db.collection.aggregate([
    {
        $addFields: {
            transactions: {
                $filter: {
                    input: "$transactions",
                    cond: {
                        $ne: [ "$$this.qtyIn", null ]
                    }
                }
            }
        }
    }
])

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