MongoEngineは、PyMongo3.0で「保存」が廃止されたPyMongoをラップします。
http://api.mongodb.com/python/current/changelog .html＃collection-changes
MongoEngineは、saveメソッドを非推奨にするか、非推奨の警告を抑制するか、またはこのPyMongoの変更を処理するためのその他の修正を行う必要がある場合があります。 MongoEngineのバグトラッカーを検索し、まだ報告されていない場合はこの問題を報告することをお勧めします。
MongoEngineのバグ-