マングーススキーマに配列を保存する

次の例のように、角かっこを使用するだけです。

const User = new mongoose.Schema({
  userId: {
    type: String,
    index: { unique: true }
  },
  laptops: [{
    laptopId:{
        type: String
    },
    available: {
        type: Boolean
    }
  }]
});

許可されているSchemaTypeについては、公式ドキュメントを確認してください。