おそらく、実行呼び出しにPL/SQLブロックを提供する必要があります。
result = DBSession.execute('begin getlogin(:username, :password); end;',
{'username':request.POST['username'],'password':request.POST['password']});
このSOの質問 SQLAlchemy +OracleSPでも役立つ可能性があります。