mysqlコマンドラインで高精度のクエリ時間を確認するにはどうすればよいですか？

これに対する最善の答えは、プロファイリングを有効にすることだと思われます。成功するリードは他にありません。

ベストアンサー、クエリプロファイリングを使用します。

SET profiling = 1;
<query>
SHOW PROFILES;