Mysql：不明な変数、mysqlアプリケーションを実行できない、my.cnfとは関係がないようです

適切な構成ファイルが/etc/my.cnf（そうでない場合もあります）であると想定して、mysql initファイルを編集し、-init-file/etc/my.cnfをmysqldコマンドに追加して実際に読み取っていることを確認します読み取っていると思われるinitファイルから。