試してみてください:
$result = mysql_query($mySelectQuery) or die("<br/><br/>".mysql_error());
$books = array();
while ($row = mysql_fetch_array($result))
{
$userID = $row{'User-ID'};
$books[$userID][$row{'Book-Title'}] = $row{'Book-Rating'};
}
これにより、書籍のタイトルが配列キー/インデックスとして割り当てられ、評価が値として設定されます。