データベースからXMLに大量のデータを保存するにはどうすればよいですか（メモリの問題）？

すべてのデータを1つのファイルに書き込み、「追加」オプションを使用してファイルを開いてみませんか？ファイルに書き込むだけの場合は、ファイル内のすべてのデータを読み込む必要はありません。

ただし、これはより良い解決策かもしれません：

PrintWriter writer = new PrintWriter(new BufferedOutputStream(new FileOutputStream("data.xml")));

while(rs.next()){
    i++;
    writer.print("\n\t<row>");
    writer.print("\n\t\t<ID>" + Util.transformToHTML(rs.getInt("id")) + "</ID>");
    writer.print("\n\t\t<JED_ID>" + Util.transformToHTML(rs.getInt("jed_id")) + "</JED_ID>");
    writer.print("\n\t\t<IME_PJ>" + Util.transformToHTML(rs.getString("ime_pj")) + "</IME_PJ>");
    //...

    writer.print("\n\t</row>");
}

writer.close();

BufferedOutputStreamは、データを出力する前にデータをバッファリングします。デフォルト値がニーズに合わない場合は、コンストラクターでバッファーサイズを指定できます。詳細については、Java APIを参照してください： http://java.sun.com/javase / 6 / docs / api / 。