これは、JDBCドライバーからのエラーのように見えます。 JDBCドライバーは、接続を初期化するときに、MySQLサーバーにいくつかのコマンドを送信します。そのうちの1つは次のとおりです。
SET OPTION SQL_SELECT_LIMIT=DEFAULT
問題は、SET OPTION 構文はしばらくの間非推奨になり、MySQL5.6では無効になりました。 MySQLのバグデータベースからの関連するバグの会話は次のとおりです。
バグ＃66659：mysql5.6.6m9がOPTIONSQL_SELECT_LIMIT=DEFAULTで失敗する
JDBCMySQLドライバーをアップグレードしてみてください。バグの会話には、ドライバーのアップグレードがオプションではない場合のその他のオプションがいくつかリストされています。