MYSQL日時、秒を削除

これは、対応する列を更新するだけの問題です。

...ハム...あなたの気分（？）に応じて試してみてください：

update tbl set datetime_column = substr(datetime_column, 1, 16);

または

update tbl set datetime_column = date_format(datetime_column, '%Y-%m-%d %H:%i:00');

または

update tbl set datetime_column = datetime_column - second(datetime_column);